Kefirin en büyük yararlarından biriside bağışıklık sistemini güçlendirmesidir.İçerdiği bakteriler sayesinde bağışıklık sistemi güçlenir ve hastalıklara karşı çok daha dirençli hale gelir.Bu yüzden kanser tedavisi gören hastalara doktorlarına danışarak kefir içmesi tavsiye edilmektedir.